身為一個骨頭愛好者，同時又對3D列印躍躍欲試，當然會想試試看把斷層掃描的圖檔轉成3D列印的圖檔囉。
兩年前寫過一篇《用CT SCAN做自己的3D模型》，但其實當初還沒學會用3D建模軟體來整理影像，以至於雖有影像，但還是不會建模。經過一年多不懈怠的努力（其實也只是偶而想起來就玩一玩），終於學會了。
於是乎就有了這一篇教學筆記，目的是幫我自己紀錄過程，免得下次我要作的時候，又要重新摸索一次。
下載DICOM檔案
想要有斷層掃描的影像，除了自己去進醫院躺在機器裡頭掃描外，也可以在「京都大學靈長類研究所」建制的「靈長類數位型態博物館」（ Digital Morphology Museum (DMM)下載。此資料庫提供非人靈長類，與其他哺乳類的MRI和CT的醫學影像。
http://dmm3.pri.kyoto-u.ac.jp/dmm/WebGallery/index.html
下載前需註冊（免費），下載後的檔案格式為DICOM。
我使用的是這隻水獺的DICOM模型
http://dmm3.pri.kyoto-u.ac.jp/dmm/WebGallery/dicom/dicomProperty.html?id=1351
將DICOM轉為STL
這過程很簡單，就兩步而已
1.用inVesalius開啟
2.設定Threshold為Bones，然後匯出surface成stl
具體的步驟，紀錄於此
開啟invesalius，將DICOM檔案匯入
可以選擇是否每張匯入，如果每張影像都匯入的話，記憶體太小的電腦可能會處理很慢。下圖的[1]可以決定是否要每張匯入
匯入之後，選擇Bone這個Threshold，這個設定值可以把骨頭的灰階值抓出來，然後按下Create Surface
製作出的立體圖像會在右下角
最後選擇Export 3D surface...存出STL檔。接下來就是去Blender修整了
用BLENDER修整模型
你以為InVesalius做出來的STL檔案就可以送進3D印表機的切片軟體嗎？不行喔，因為那個STL檔太多細節，而且還有破面，所以我們就要用Blender去大幅修整
本來的影像切片看起來是這樣，頭骨的內壁也一起被掃出來了，但是3D列印時，是不需要內壁的。
最後就是要處理成這個樣子
整體的過程我就用影片來說明吧，影片底下有整理了各種指令的快速鍵
檢視
數字鍵盤5：切換透視和正射投影（Perspective and Orthographic Projection）
數字鍵盤137：分別切換前視、右視、俯視（加上ctrl則是仰視、仰視、仰視）
其他數字鍵盤則是微調角度
切割出要的部份
1.進入Edit Mode
2.按下a全選，在左側Tools的Add:，有個Bisect。點選後，在畫面點擊畫出一條切割線。左下角視窗可以調整線的位置與Plane Normal。依據Plane Normal的數字，如果Plane的法線是1，而不要的部份是在朝外的方向，就選取clean outer。
移動物件到場景中心
1.按下Shift+Ctrl+alt+C（或是在Object Mode中，左側Object Tools(按下T出現的視窗)，選擇Set Origin，選擇Origin to Center of Mass。這是將物件原點設定為物件的質心
2.右側Transform視窗中，調整Location與Rotate之後，按下ctrl A（object/Apply)，套用改變的位置與角度。
如果需要將特定位置指定為物件原點，例如物件的底腳，則先進入Edit Mode，Mesh Select Mode(Ctrl+Tab)選擇Vertex，點選特定點之後，按下Shift+S（Mesh/Snap/cursor to select)。然後進入Object，按下shift+ctrl+alt+c，設定origin to 3D cursor。
選取方式
在Edit Mode，按B，可以用方形選取，若是用套索Lasso選取方式，則是按下Ctrl+左鍵。
- 找出與選取區相連的線條或面，Ctrl+L(Select/Linked)
- 相反選取，Ctrl+I(Select/Inverse)
- 將選取區隱藏和呈現：H和alt+H
- 在線條選取模式下，按alt+L點擊線條，可以選出相連一圈的線。按下F(Mesh/Faces)可以做出面。Ctrl+T(Mesh/Triangulate Faces)可以將面做成三角形。
- 要觀察物件內部，可以用Alt+B（View/Clipping Border)
- 找出沒有成面的線條：Shift+Ctrl+Alt+M(Select/Non Manifold)
- 刪除時，選擇刪除vertices，可以刪除比較乾淨
柔化物件
在Object Mode，最右邊的視窗，選取扳手圖示，Add Modifier，選擇Smooth Modifier，改變Repeat。
匯出stl檔案
File/Export/Stl...
最後製作出的STL檔，我放在Thingiverse
http://www.thingiverse.com/thing:1394568
