2017年7月14日

ImageJ分析細胞面積-當細胞膜顏色很淡怎麼辦

前兩天收到的信,今天才有空處理。

研究者拍攝的是脂肪組織,希望精確知道每一個細胞的面積有多大。

在大多數的情況下,「精確」和「快速」兩者無法兼得。要精確,就只能慢慢來,要快速,那麼精確度就會下降,只能粗估。

這個案例我試了幾個方法,雖然可以快速,但是精確度不高,所以最後決定建議研究者用手動+自動的方式一起進行。

既然細胞膜顏色太淡、太薄,那就手動幫細胞膜上色吧。上了色之後,再利用threshold和analyze particle把每個細胞都抓出來,這樣就完成了。以範例這張照片來說,手動畫出細胞膜費時也只有數分鐘,但是可以得到相對準確的細胞面積,算是值得了。




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