可是樹木就不一樣了，他們對付傷口不是用復原的方式，而是用一種極其微妙的方式來處理。美國學者Alex Shigo(1985)提出了「腐朽區隔理論」(CODIT，Compartmentalization Of Decay In Trees)，說明樹木並不是去修復死亡的組織，而是在腐朽部位的周圍形成防禦層，防止感染擴散。也就是說受傷了就把傷口包覆起來吧，外頭繼續長新的細胞就行了。
以腐朽菌的角度來說，千辛萬苦從傷口穿過樹皮進入木材，目的當然是極盡可能的向上下和向內外擴散移動。而樹木面對腐朽菌的入侵威脅，就是用四道防線阻擋他們。
- 第一道防線：木材內的導管或假導管(管胞)就像是一根根兩端扁的吸管，腐朽菌面臨的第一道防線就是這些管子相接的薄牆，可想而知，這第一道防線是最弱的牆。所以腐朽菌進來之後最容易向木材上下侵略。
- 第二道防線：當腐朽菌意圖向樹心方向前進時，會遇到晚材或心材部，相對於第一道，這裡稍強一些，可以防止菌向內部擴張。
- 第三道防線：腐朽菌也會往側邊移動，而這個方向，他們將遇到樹木的木質線細胞（射髓），這層雖然是薄壁細胞所構成，但不同於前面兩道牆，這是道活細胞建構的牆，這些細胞可以分泌化學物質抵抗腐朽菌，這裡有第二強的防禦能力
- 第四道防線：腐朽菌從外頭的小傷口進來之後，還會來個回馬槍，往鄰近的樹皮攻去。在這裡將會遇到樹木形成層建構的隔離區，這裡可具有最強的防禦能力呢！
現在就來看看最近收集到的素材，這是常見於造景用的木樁，很明顯的看出秋材這道牆的厲害了，至少比春材好多了。
接下來這是香楠的枯枝，一段段切開來看看裡頭的那些城牆。
這個部位是側枝被腐朽菌入侵之後，樹木的第一道防線，這裡防禦能力不算太強，所以很容易讓腐朽菌繼續進入其中。
這個切面可以看到第二道到第四道防線的威力，腐朽菌從樹皮傷口進入之後，往樹心一步步突破，目前被秋材的第二道防線阻隔，往兩側則是被射髓分泌的化學物質擋住，而回頭往樹皮則是被形成層形成的隔離區擋住。順利的話，就可以把整區封鎖起來。
以上這四道防線，前兩道弱的幾乎靠死細胞的物理阻隔，而後兩道則是靠活細胞分泌化學物質來阻擋。這些化學物質怎麼來呢？來源是葉子進行光合作用合成的養分，然後儲存在根和莖的碳水化合物。當大樹沒有足夠的葉子可以行光合作用，或是因根部衰弱，導致沒有足夠的碳水化合物可以合成抗菌的化學物質時，這後兩道防線也形同虛設了。也因此大樹健康的基礎就來自根的健康，養樹必須顧根本。莫怪俗諺這麼說「樹頭若顧(站)好在，不怕樹尾做風颱」
