阿簡生物筆記: 2007-02

2007年2月27日

一定要推開放原始碼軟體

學期開始請學生繳交種植植物的觀察紀錄
我不限定繳交的方式，不論是手繪或電子檔都可以
即使是電子檔，我也沒限定用什麼檔案給我
最後問題來了
學生家中的電腦居然已經是Office 2007了
因此預設儲存的檔案格式都是我無法開啟的檔案
所以，我得一個一個教他們如何另存新檔
然後改儲存的檔案格式，這樣我才能讀取他們的檔案。

如果他們都能改用Open Office.org或是其他開放原始碼的軟體
就不會有這種不合邏輯的事情了-舊版的軟體居然無法開啟新版的檔案
被逼的只好跟著一起升級？
在未來用微軟的軟體恐怕都無法「開啟舊檔」了

目前辦公室的電腦用的是win xp+office
家中的電腦是linux的Ubuntu
辦公室是因為有交換檔案的需求
不然我很想一起換成linux的系統

用了這幾個月的Ubuntu後
深深體會擁抱開放原始碼的軟體，世界更自由啊
有一大堆好玩的軟體可以玩
而且很多都是免費，而且功能強大
超讚！

文書處理軟體可以用Open Office.org的oowriter
畫圖可以用ooDrow
在Open Office.org補給站當中，同為生物領域的笨牛提供了這樣的檔案
個人的實驗儀器圖形範本-OOo Draw
我想一定會有人需要啦
大家參考參考

2007年2月24日

竹北海岸原生林

趁著假期快要結束，今天到竹北海邊看一個特別的地方-竹北仙腳石海岸原生林保護區

在往新竹方向的台61線上可以看到往原生林保護區的指標
我經過好幾次了，卻從也沒進去看過。

根據網上看到的資料。西部海岸僅存的兩處海岸原生林，一處在這，另外一處就在墾丁的香蕉灣。

墾丁香蕉灣的原生林保護區只有開放一小塊地方讓遊客參觀。
內行的可以在裡頭看到不少好東西，外行的沒幾分鐘就會被蚊子趕出來。
像我們這種同時內行和外行特質兼俱的在裡頭也只是走馬看花兼被蚊子咬。

竹北這處的海岸原生林在Tony的自然人文旅記第0251--石門洞這篇提到曾經是台灣史蹟名勝天然紀念物。
不過後來因為人工林如木麻黃等植物也進入此地，這裡的植物種類也不再像從前那麼多了。
相關的研究報告，只找到一篇

行政院農委會林務局全球資訊網 ─ 28卷　第1期／民國91年2月竹北海岸地區原生林調查研究報告

雖然有人工林的進入，但在沒有干擾的情況下，還是會逐漸演替到自然的狀態。但是那要多久？

這裡面積不大，但是步道的規劃很不錯，是可以看到不少特別的植物景觀。

不過有些可以更好的地方

植物解說牌旁都看不到被解說的植物(死亡？)
原生林裡有很多墓地

如果要來這裡參觀，不妨順道去烏魚養殖區看看，這裡的烏魚可都是吃藥變性來的。
另外蓮花寺溼地也是不錯，但是不容易找到進入點。
或者可以到紅樹林區看看。

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竹北市公所全球資訊網

本市「仙腳石海岸原生林」早在清乾隆27年（西元1762年）就已經被發現，由於這塊防風林內樹種之多為當時所罕見，所以居民稱之為「百樣林」，日據時代也被列為天然資源而加以保護。在台灣西部海岸原生植物帶隨經濟開發被破壞殆盡的情況下，本市的「海岸原生林」已是全國僅存的海岸生態資源，因此顯得彌足珍貴。但據學者調查，其內的樹種在民國21年有305種之多，到了民國79年竟驟降到只剩102種，可見其所受破壞的嚴重。

Web 2.0的服務在教學上的應用

在網路科技如此發達的世界

資訊融入教學不會只是用用「有力的點」如此狹隘

過年在家無事亂晃

看到了這系列用web2.0服務在教學上的應用

挺有趣的，而且也很實用

這篇介紹原文來自以下連結Back to School with the Class of Web 2.0: Part 1

School 2.0

在這個網站中有個School 2.0的圖

當資訊層面進入學校，學校可以有怎麼樣的變革。

Online Office « 雨後的天空

介紹web-base的office系列應用，而且有中文的實際測試。

Cool Cat Teacher Blog: Cool tools in my cool classroom

這裡可以看看國外教師如何應用這些網上服務

2007年2月22日

看看你家的狗有沒有自我意識

要測試動物是不是有自我意識其實很簡單。
只要用鏡子就行了。

1970年代，美國心理學家Gordon Gallup提出了一個mirror test來測試動物是否有自我意識。
方法是在動物沒察覺的情況下在頭上用漆做了標記，然後讓牠們照鏡子。
如果有自我意識，他們會認得鏡中的動物是自己，於是會去碰觸或是抹去標記。
在目前的研究中，人類(18個月大以後)、大象、黑猩猩、瓶鼻海豚...等都經由這個實驗證實是有自我意識的。

那我家那隻笨狗呢？
我們也可以如法炮製一番。

先偷偷把標籤貼在牠的頭上，可別讓牠察覺了。
這是我晚餐keroro便當的標籤

接著讓牠照鏡子。
牠看到鏡子中的自己之後，才會發現頭上被主人貼了標籤。
然後就會拼命把標籤弄下來。

經過這個實驗，我也證明了我家的狗也是有自我意識的。

關於自我意識的說明可以看wikipedia是怎麼說的
http://en.wikipedia.org/wiki/Consciousness

2007年2月14日

病毒殺死全人類

看起來很恐怖的標題
不過目前為止，這還只是個遊戲。請放心！
http://www.crazymonkeygames.com/playnewpandemic.php

在這個遊戲中，你要改變並控制病毒的特性，在200天內感染全世界的人類，然後讓全世界的人類都死亡。
在這個討論串中有對岸的網友針對這個遊戲的討論
病毒的特性包括
lethality：致命力
infectivity：感染力
visibility：能見度病毒被發現的能力
http://www.tamiaode.com/txt/6114581642214726.htm

設定病毒的畫面在右下角處
網上已經有人把設定頁翻譯出來
可以到這邊一看
http://mars.pseric.com/wordpress/?p=208#more-208
設定症狀需要點數，而取消症狀也需要點數

據說，要把人類全殺死的關鍵就是一開始先取消human only，也就是先來個人畜共通。然後儘量把症狀減輕，讓大家不知不覺地被感染。先增加感染範圍，最後死的人就會變多了。

驚人的圖像記憶力-人腦照相機

看過「火星上的人類學家」這本書嗎？
作者是奧立佛薩克斯(Oliver Sacks)這位偉大的神經學教授
在這本書中有這樣一段描述

Stephen Wiltshire 是個天才小畫家，七、八歲時，就發展出驚人的天賦，只需瞄上幾秒鐘，他就能將最複雜的建築物或成是景觀盡收眼底，再以十分純熟的記法及細膩的線條，精確地描繪出來。然而，他卻是個標準的自閉兒…

今天正巧在del.icio.us看到了Stephen Wiltshire 的影片，實在只能說了不起啊
他搭乘直升機逛羅馬一圈，下來之後居然就可以畫出羅馬全景

在他的個人網站上還有更多的採訪影片，也是很驚人啊
http://www.stephenwiltshire.co.uk/

2007年2月13日

到關西看人家養菇

前幾天阿簡騎著單車到羅馬公路繞了石門水庫一大圈，總共騎了105公里。真是太爽了，不過回來的時候又「鐵腿」了

就在經過關西台三線的時候，忽然瞥見了一個大招牌-錦鴻養生菇園

這讓我十分感興趣，因為我一直想看看太空包養殖菇類

竹東這附近當然也有人種菇，不過是段木養殖香菇。

隔天我就開著車到這個地方一探究竟

哈！這個地方居然是木材廠(你可以試著把電話號碼丟進Google)

之前就先打過電話告訴老闆我想來買太空包

所以老闆就帶著他媳婦來跟我介紹這個養殖的過程。

因為養菇的部份主要是媳婦負責的。

在養殖這些菌類前，要先把雜菌殺掉。所以它們有一個超大的滅菌箱，裡頭大概可以塞十個人進去滅菌。

最令我意外的是，我一直以為這些菌類是利用孢子來做繁殖的，結果?

他們先把子實體切成小塊放在培養基上，在恆溫25度C培養下，這些子實體就會長出菌絲

最後菌絲會散布整個培養皿

接下來就可以作接種的動作，就是把菌絲塞到滅菌過的木屑、米糠裡頭

後面那一瓶只要放在適當的環境下就可以準備出菇囉

所謂的適合環境，每一種菇類都不同，像這一種是杏鮑菇就要放到17 ~18度C左右。

養菇還真是有趣哩

之後我打算在家裡試試看用子實體讓菇菇長菌絲，不過別長出黴菌啊。

象草開花囉

我家附近河邊的象草開花了

這種單子葉植物的花小到令人忽視，事實上它正在開花。

一開始是每朵小花的雌蕊先成熟伸出來。

所以整個看起來是毛毛的。

過一陣子換成雄蕊成熟，它就會把花藥伸出來。所以就會有不一樣的「毛」樣

再近一點看，其實雌蕊的柱頭是羽狀的

已經伸出雌蕊的花，它的雄蕊花藥還躲在花裡頭呢！

如果這朵小花受精了，裡頭就會有種子形成囉

為了要看這朵小花的種子，居然不小心把種子擠爆了，不過裡頭還是胚乳，所以擠爆的時候，其實是一堆湯汁噴出來啊。

重點來了，因為情人節快到了，所以總是要想想該送什麼花給梅子。

就這樣決定了，今年要送梅子577朵花。

為什麼是這個數目，因為這是我花了半個小時，把一支象草花序的花辛苦拔下來算的。

僅以這577朵象草小花送給我親愛的老婆大人。

2007年2月9日

解剖雞心的經驗分享

我在西米露小站分享解剖雞心的活動後
ferny學妹實際帶學生操作了
我覺得做得真棒
我確定這是一個可以替代解剖豬心的實驗
而且材料簡單，器材也簡單
一節課可以搞定

推薦各位一定要看看她是怎麼作的
http://www.wretch.cc/blog/fernyant&article_id=6097387

骨骼標本二三事

進入生物相關科系的大一學生
在普生實驗中都會遇到要做青蛙骨骼標本的時候。
對多數人來說這可能是第一次作骨骼標本，也有可能是最後一次。
只有少數人在未來還會繼續對骨骼著迷。
我的同學中最有意思的就是中山女中最不可思議之艦長
他對骨骼的研究相當深入。

要完成骨骼標本最困難的的兩件事分別是
1.把肉弄掉
2.把骨頭拼起來

要處理掉肌肉組織和韌帶、肌腱等結締組織可以有很多方式
一般處理方式就是煮熟後慢慢剪掉挑掉，或者用鹼液處理。
當然也有其他處理方式，例如用蟲蝕法。

我和梅子以前曾經到市場特別去買了豬龍骨(脊椎骨)
想要作一串脊椎骨的標本
當時就是採用蟲蝕法
我們看了網路的資料，據說用麵包蟲就可以了
但是我們把麵包蟲放進去以後
過了一天，幾百隻蟲全部死光光(或者都休眠了?)
所以當時並沒有做出來

除了以上的處理方式，我目前處理骨骼標本都是用酵素處理
這種方式好處多多
特別是在處理小骨頭

上面這個頭骨是一隻麻雀的幼鳥的
不過我得先說明，我不會沒事就去殺鳥
這是在桃園的沙灘上撿到的屍體

這麼小而薄的骨頭
如果用鹼液處理大概什麼就沒有了
所以我也是採用酵素處理

如果你財力雄厚可以去買pepsin，那一小罐就上千元了。
我沒什麼錢，所以就用木瓜酵素(papain)
未經過修飾的酵素，最適溫度可能高達70度C
但經過修適後的酵素，最適溫度大概只要30~40度C
木瓜酵素在化工原料行就買得到
或者你可以到超市去買嫩精也可以

做法很簡單，煮熟之後把酵素加進去就不用管它了
過一陣子等肉都被分解就可以了

不過酵素量和時間我並沒有詳細紀錄
因此都是隨意加進去的。

這堆骨頭也是用酵素處理的，是大學同學的婚宴中的一道菜

2007年2月7日

蛇骨標本製作-上集-酵素真是好東西

在去年(2006)10月22日的時候，我和梅子騎著單車到橫山的田寮晃
眼尖的梅子看見路旁一條大蛇
當時我們還不知道是什麼蛇
不過後來把照片寄給了阿肥鑑定
阿肥立刻就告訴我啦！答案是過山刀

阿簡我骨頭收藏中還沒有蛇類進入
所以這條蛇我就把他帶回去家裡處理囉

不過這條蛇很麻煩，因為死了一陣子了
身體已經腐敗發出很嚴重的屍臭味
而且還長蛆了
在我手提著蛇屍袋騎單車回竹東的路上，可是引起眾多路人的側目啊

回到家之後款好所有工具準備上工

戴上帽子以免味道沾染頭髮
戴上口罩避免臭暈
手套也準備好，不然手一個禮拜都洗不乾淨啊
剩下的就是生物老師必備的解剖工具們啦
我還特地去買了解剖專用的鍋子

這條蛇的長度大約兩米，抓起來比我還高
原本我是打算掛在牆壁上，先脫蛇皮下來收藏

不過因為我一回來就拿整罐漂白水倒下去桶子裡消毒消臭
以至於整條蛇又爛又臭(原本只有屍臭，現在是漂白水臭+屍臭)
不過蛆倒是死光光了

變成爛蛇的結果就是皮也剝不下來，要拿線先穿好脊椎也做不到，因為都散了

看到我這麼難過的表情就知道味道有多臭多嘔吧

處理到最後，再也不想弄了
於是趕緊進行下一步驟

煮蛇！

這個步驟是要讓蛇肉的蛋白質變性，未來比較好去肉

在這裡我不得不大大稱讚酵素的好啊

我在這鍋蛇湯當中還另外加料
那就是蛋白質分解酵素

左邊是嫩精，是從青木瓜萃取出的酵素，很便宜，超市就買得到
右邊是純化過的木瓜酵素，是在第一化工買的
兩者的用途都是一樣--把蛋白質分解
人家是用來去粉刺，我是用來煮骨頭

不要以為煮過了就會有肉的香味

其實這鍋煮過的蛇湯一樣臭
我實在不想多聞他一秒鐘

於是就趕緊加了酵素進去，接著就是放進黑色塑膠袋，塞在後陽台的角落裡
打算等到哪天我想起來後，我才會去處理他。

在這段期間，其實我還有過要把整鍋蛇湯拿去山上丟掉的念頭，因為實在臭到無法忍受。
光想到要打開就覺得有很大的障礙。

在我過去的解剖經驗中
最臭的應該是鯊魚
這個比鯊魚臭3倍以上

而這鍋蛇湯直到四個月過後的某一天我一個人在家，我又想起它了
這回鼓起勇氣，把蛇湯從後陽台的角落裡拿出來

口罩戴上去，心想臭就給他臭吧，反正暈倒了老婆會回來救我

打開鍋蓋

哇！！

一點都不臭，最多最多就是一點點氨的味道
而那時候沒清完的蛇皮、蛇肉在鍋中已經消失，只剩下鍋底的一堆白骨和黑泥(這個不知道是什麼)

經過沖洗之後，就變成了下圖的這個樣子了。
這是還沒經過漂白的骨頭哩，如果經過漂白一定更美
不過問題也跟著來了，這裡頭大概有超過兩百個脊椎骨
我要怎麼拼回去？

一切就留到下集再說吧

蛇骨標本製作-中集-這裡不只有蛇骨

2007年2月6日

部落格專訪之「讓人不得不愛上生物的部落格」

就在上週突然接到了個陌生人的電話
中時部落格要跟我約個時間來專訪部落格
訪問我的人光聽名字我是不知道是誰啦
不過一說起他在網路上的暱稱
我就完全熟起來了
他的名字叫作「小眼睛先生」

會知道小眼睛先生完全是因為「自助旅行」
因為他曾經在台大椰林發表過好幾天自助旅行的文章
我是從那時候開始認識他的
不過，他那時候還不認識我

能被他訪問到，感覺很棒，因為他引導了我去想一些我沒去接觸到的東西

歡迎大家看看這篇專訪吧！！
讓人不得不愛上生物的部落格

有這麼幽默風趣、充滿熱情，把一生與生物結合在一起的老師，那有誰能不愛上生物呢？

2007年2月2日

部落格新聞我也參一腳

上網沒事作的時候，我會到google找我的名字，找我的部落格。
看看我又在什麼地方出現了。

昨天突然看到一篇報導有我的部落格耶
有興趣的不妨來看看
部落格有啥了不起？

【阿簡生物筆記】部落格便是這麼一個從生活入門，在生活中取材應用的生物實驗應用部落格。
舉凡，病毒感染紅血球的遊戲、顯微鏡觀察肌肉細胞、人體解剖秀、我們的島，人蟲戰役、煮竹筍的食品科學、製作豬腳骨骼標本等等兼具生物科學與實用生活應用樂趣的科學探索，在【阿簡生物筆記】部落格中都可以尋得絕對簡單易懂的科學應用樂趣與知識性的學習。