一直以來用imagej處理細胞影像，頂多都是作到面積而已，不過前兩天一個中山大學的學生來信，問到想要處理細胞體積，於是我摸索了一下，錄了一段影片給他，我想未來應該會有人需要吧。
需要的plugin如下
3D Roi Manager
http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=plugin:stacks:3d_roi_manager:start
3D Object counter
http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=plugin:analysis:3d_object_counter:start
正式處理影像之前出了一點小狀況，我處理了一陣子才搞定。事情是這樣的，我是用fiji來處理影像，其實3D Object counter都是已經安裝好的，而3D Roi Manager據說是在fiji裡頭有，但是我沒有找到。而依照安裝說明去安裝，卻還一直不能執行，說是plugin沒有找到java3D，所以後來我就把fiji裡頭本來的3D Viewer刪除之後，重新再下載安裝一次，然後它就會自動再安裝java3D，接著就可以用3D Roi Manager了。
備註：fiji就是已經預裝了很多plugins的imagej